Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
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MKRN3Q13064 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
MKRN3Q13064 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
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MKRN3Q13064 RUNX1T1-249ENST00000613886 7401 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
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MKRN3Q13064 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 MDGA2-203ENST00000426342 2871 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 TMEM45A-201ENST00000323523 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
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MKRN3Q13064 SLC23A2-201ENST00000338244 6944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 DNAH9-215ENST00000608377 3147 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 PLEKHM3-202ENST00000427836 9807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
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MKRN3Q13064 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 H2AFZP3-201ENST00000394213 387 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
MKRN3Q13064 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
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