Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AL391117.1-201ENST00000640003 1186 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 RAET1L-202ENST00000367341 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 TRAV9-1-201ENST00000390431 338 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC019084.1-201ENST00000457337 432 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC007370.1-201ENST00000503163 316 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AL499605.1-201ENST00000604628 403 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 PSMA2P2-201ENST00000504319 686 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AP001120.2-201ENST00000589395 296 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
IFFO1Q0D2I5 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132 ms