Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC016839.1-201ENST00000578162 867 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 FRG1EP-201ENST00000634469 770 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
E2F1Q01094 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
E2F1Q01094 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms