Protein–RNA interactions for Protein: P78333

GPC5, Glypican-5, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC5P78333 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GPC5P78333 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GPC5P78333 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GPC5P78333 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GPC5P78333 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GPC5P78333 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GPC5P78333 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GPC5P78333 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GPC5P78333 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GPC5P78333 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GPC5P78333 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GPC5P78333 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 FAM96AP1-201ENST00000430879 482 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 RN7SL423P-201ENST00000486202 304 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 AC018541.1-202ENST00000518687 584 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 FOPNL-207ENST00000575073 530 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
GPC5P78333 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPC5P78333 JCHAIN-201ENST00000254801 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPC5P78333 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPC5P78333 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPC5P78333 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPC5P78333 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPC5P78333 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPC5P78333 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPC5P78333 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPC5P78333 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPC5P78333 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPC5P78333 RNU6-1251P-201ENST00000364502 107 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPC5P78333 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPC5P78333 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPC5P78333 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPC5P78333 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPC5P78333 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPC5P78333 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPC5P78333 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPC5P78333 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPC5P78333 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPC5P78333 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPC5P78333 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPC5P78333 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPC5P78333 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPC5P78333 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPC5P78333 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
GPC5P78333 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPC5P78333 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
GPC5P78333 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms