Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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CASQ1P31415 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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CASQ1P31415 ZNF701-207ENST00000611267 1136 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
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CASQ1P31415 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
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CASQ1P31415 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 F9-202ENST00000394090 1272 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
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CASQ1P31415 GTDC1-212ENST00000463875 1563 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
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CASQ1P31415 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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CASQ1P31415 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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CASQ1P31415 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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CASQ1P31415 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
CASQ1P31415 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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