Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 KNL1-201ENST00000346991 9573 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 PLXNC1-205ENST00000547057 2455 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
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PTPRMP28827 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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PTPRMP28827 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PTPRMP28827 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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PTPRMP28827 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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PTPRMP28827 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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PTPRMP28827 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
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PTPRMP28827 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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PTPRMP28827 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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PTPRMP28827 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRMP28827 AC090371.2-205ENST00000580366 490 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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