Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
PTPRBP23467 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 JAKMIP2-205ENST00000507386 5915 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 PLS3-201ENST00000289290 2277 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 RNA5SP387-201ENST00000364226 106 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
PTPRBP23467 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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