Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC092824.1-201ENST00000483524 576 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 PLEKHA3P1-201ENST00000598554 894 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 PHYHIPL-201ENST00000373878 3569 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL391262.1-201ENST00000556558 1992 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 CUBNP3-201ENST00000457461 1784 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 ALS2CR12-203ENST00000405148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 PIGN-207ENST00000586566 3891 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 VIP-201ENST00000367243 1581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 OFD1P10Y-201ENST00000434110 1433 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
HOXD8P13378 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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