Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC013724.1-201ENST00000511962 783 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC099805.1-205ENST00000521794 837 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC103681.2-201ENST00000527450 567 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AP002336.1-201ENST00000531426 422 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 RPS11-205ENST00000599561 430 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 BNIP3P38-201ENST00000601117 544 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC009283.1-201ENST00000615852 645 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC027559.1-201ENST00000636288 271 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 LINC01224-203ENST00000596283 2766 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC010132.4-201ENST00000569883 1368 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 Y_RNA.209-201ENST00000364156 111 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 RNA5SP35-201ENST00000391257 129 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 RPL3P11-201ENST00000434028 1146 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC239800.1-201ENST00000442049 719 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AC019186.1-201ENST00000447019 545 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VPREB1P12018 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms