Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 CYFIP1-208ENST00000617928 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 AC006042.3-201ENST00000454684 1469 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.94
PKHD1P08F94 LINC01268-201ENST00000434296 2755 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 VN1R37P-201ENST00000419096 748 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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PKHD1P08F94 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 SMAD5-211ENST00000545279 7012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 UTY-215ENST00000618474 6277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
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PKHD1P08F94 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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PKHD1P08F94 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 FBXO40-201ENST00000338040 5929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 DOCK8-205ENST00000453981 7237 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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PKHD1P08F94 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
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PKHD1P08F94 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ONECUT2-202ENST00000491143 16121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 C6orf89-204ENST00000480824 6861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 GON4L-201ENST00000271883 7138 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
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PKHD1P08F94 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 HERC2-201ENST00000261609 15337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 LRRC37A6P-202ENST00000448648 5444 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 LIMD1-201ENST00000273317 11331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
PKHD1P08F94 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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