Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 CHCHD2P7-201ENST00000508008 452 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 VDAC2P2-201ENST00000544463 901 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 RPL3P13-201ENST00000550415 216 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 HIGD1AP9-201ENST00000550710 279 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 OR4N2-203ENST00000557677 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 NDUFA3P1-201ENST00000588007 252 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC005899.7-201ENST00000618199 588 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC026108.1-201ENST00000635444 547 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 LINC01505-203ENST00000435485 1686 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 RBPJ-214ENST00000507561 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 SORBS1-207ENST00000371239 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 ELMOD2-201ENST00000323570 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 ELMO1-202ENST00000396040 1982 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 Z93022.1-201ENST00000433228 1554 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 DDX18-201ENST00000263239 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 RPSAP1-201ENST00000421328 880 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AL122008.4-201ENST00000446433 388 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 RPL7P14-201ENST00000449851 741 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 RN7SL815P-201ENST00000470970 290 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC098487.1-203ENST00000512915 546 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC022639.1-202ENST00000524360 581 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 C14orf119-202ENST00000554203 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC092868.2-201ENST00000558749 497 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
PHACTR1Q9C0D0 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.8 ms