Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC024940.4-201ENST00000605507 246 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
ZNF548Q8NEK5 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
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