Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 SAA3P-201ENST00000533267 365 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC133552.5-201ENST00000604266 540 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 SUMO2P15-201ENST00000604285 278 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 VIRMA-202ENST00000421249 3924 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 MAPK10-251ENST00000640858 3052 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 PDE4B-207ENST00000480109 2037 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 ZHX3-217ENST00000560361 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC011592.1-201ENST00000624647 3634 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 LINC02466-201ENST00000500092 1963 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 MIR143-201ENST00000385300 106 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 DAOA-AS1-201ENST00000448407 2482 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC129807.1-201ENST00000471614 591 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 TSHZ2-205ENST00000626626 670 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 VTCN1-201ENST00000328189 2289 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 LINC01776-201ENST00000418344 2229 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 PKIB-211ENST00000615438 1936 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms