Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 SLC16A1-AS1-204ENST00000428411 8757 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 MAP2-207ENST00000447185 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC105342.1-201ENST00000378334 6848 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 GPR161-201ENST00000271357 7806 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 CTNND1-207ENST00000426142 5800 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 DNAJC6-201ENST00000263441 5916 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 TLK2-214ENST00000582809 3608 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 ADGRL3-213ENST00000509896 5069 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 PAX6-270ENST00000640368 6975 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 LIN7A-204ENST00000552864 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 TNRC6C-202ENST00000335749 9740 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 EPS8-213ENST00000543612 2965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 FAT1-212ENST00000614102 14758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 CU638689.4-201ENST00000623047 5990 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 CECR2-206ENST00000612582 9645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 HDAC2-AS2-207ENST00000518470 563 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 SKA2-207ENST00000583380 583 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 CDON-202ENST00000392693 9138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 ZHX3-211ENST00000544979 3933 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 TXNRD1-205ENST00000503506 3930 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 ERC1-202ENST00000355446 5796 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 NT5DC1-201ENST00000319550 6923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RYR3Q15413 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
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