Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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COL4A6Q14031 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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COL4A6Q14031 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
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COL4A6Q14031 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 LINC00632-204ENST00000602830 597 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AL391422.2-201ENST00000602854 361 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 MYBPC1-202ENST00000361685 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
COL4A6Q14031 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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COL4A6Q14031 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
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COL4A6Q14031 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
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COL4A6Q14031 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
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COL4A6Q14031 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
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COL4A6Q14031 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
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COL4A6Q14031 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AC023136.1-201ENST00000513093 1105 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL4A6Q14031 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
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