Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC109635.6-201ENST00000525487 1113 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 EIF4A2P5-201ENST00000529914 499 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 PYM1-205ENST00000547925 499 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 RNU4-39P-201ENST00000362455 127 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 DAZAP2-204ENST00000439799 701 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 LINC02301-201ENST00000553760 773 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
ALCAMQ13740 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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