Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
ATP1A4Q13733 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms