Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
NEUROD1Q13562 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 RABGAP1L-206ENST00000367688 1425 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 TNFSF11-205ENST00000544862 818 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 NPM1P29-201ENST00000483112 803 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC005692.2-201ENST00000566521 596 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
NEUROD1Q13562 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms