Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 RNU6-31P-201ENST00000384388 108 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 HSPA8P15-201ENST00000401676 786 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC026320.1-202ENST00000444729 672 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 MIR8084-201ENST00000614105 89 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AP002478.1-201ENST00000577848 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 VNN3-211ENST00000509351 1700 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
TCIRG1Q13488 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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