Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC097376.2-202ENST00000608345 433 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC139713.2-214ENST00000642059 1811 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 GTF2IP2-201ENST00000424290 697 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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SRSF5Q13243 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 LINC00348-201ENST00000428761 948 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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