Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BPTFQ12830 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 DIO2-201ENST00000422005 6272 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 ZNF226-213ENST00000588883 5972 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AL031668.1-201ENST00000451556 603 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 DICER1-204ENST00000527414 6179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC003985.2-201ENST00000562268 1669 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 ST13P16-201ENST00000401760 781 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
BPTFQ12830 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms