Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 LINC01058-201ENST00000420694 448 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 OR8A2P-201ENST00000528631 952 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC018638.7-201ENST00000605836 1114 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 MIR4435-2HG-203ENST00000409569 514 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 CNOT7P1-201ENST00000429006 852 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC104071.1-201ENST00000505636 602 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TMEM225BP0DP42 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.1 ms