Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 BVES-AS1-202ENST00000369122 1716 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 ZNF407-203ENST00000577538 5794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 ZNF131-201ENST00000306938 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 NOX1-204ENST00000372966 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 DIAPH3-206ENST00000465066 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 CFI-201ENST00000394634 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 DEUP1-209ENST00000531792 1656 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 RIF1-206ENST00000453091 8053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 CNOT4-206ENST00000428680 4642 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 PPIAP26-201ENST00000377951 522 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 UBBP1-201ENST00000392399 473 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 AC136188.1-201ENST00000546770 342 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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C9orf172C9J069 MIR3135A-201ENST00000578460 77 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 AC009977.1-201ENST00000586015 570 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
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C9orf172C9J069 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
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C9orf172C9J069 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
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C9orf172C9J069 TSHR-201ENST00000298171 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 NAPEPLD-209ENST00000465647 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 ZG16-201ENST00000400752 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 IFT74-204ENST00000443698 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 AADACL3-201ENST00000359318 3662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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C9orf172C9J069 AC008676.2-202ENST00000509655 1992 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 FTO-206ENST00000471389 11766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 UGT2B25P-201ENST00000511504 1586 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 ALS2-201ENST00000264276 6644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 TDRD3-209ENST00000621840 2497 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 SNORD35A-201ENST00000363389 86 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
C9orf172C9J069 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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