Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 TCP11X1-202ENST00000622971 1372 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 CLEC4A-204ENST00000360500 597 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 KRTAP3-1-201ENST00000391588 594 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
SH3BP4Q9P0V3 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
SH3BP4Q9P0V3 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms