Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 CASC19-260ENST00000641828 2001 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 SMIM2-IT1-201ENST00000415082 478 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AC016550.3-201ENST00000515706 767 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 RNASE9-204ENST00000553541 1136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AC233266.2-201ENST00000567067 528 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
TMOD4Q9NZQ9 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms