Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 DPPA2P4-201ENST00000563717 878 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1192P-201ENST00000612197 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-489P-201ENST00000618289 107 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC010374.1-201ENST00000503762 1237 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RBPJP2-201ENST00000618187 1444 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
TRAPPC9Q96Q05 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms