Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 ENSA-214ENST00000513281 1369 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AL161722.1-201ENST00000446972 1032 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC068492.1-201ENST00000448672 469 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 BX284632.1-201ENST00000478218 541 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 GOLGA5P1-201ENST00000507317 980 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
GTF3C6Q969F1 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.9 ms