Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 DDX11L16-201ENST00000507418 1306 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 EEF1A1P5-201ENST00000436459 1389 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC106800.1-201ENST00000501221 1362 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 ASB14-201ENST00000389601 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 ASB14-202ENST00000487349 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AP000766.1-201ENST00000561746 4140 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL354719.2-201ENST00000429530 1454 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 REN-202ENST00000638118 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 UTP4-204ENST00000563094 4183 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 DDX60-201ENST00000393743 6071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 CCL13-201ENST00000225844 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 LINC01702-201ENST00000230113 487 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 OR6T1-201ENST00000321252 1089 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP25-201ENST00000362449 308 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 SALL4-202ENST00000371539 1151 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL034417.1-201ENST00000399343 800 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC012462.3-201ENST00000412951 131 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 PPIAP30-201ENST00000415473 519 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC127537.1-201ENST00000418183 748 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL031584.2-201ENST00000420585 767 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 CFL1P7-201ENST00000424759 486 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL133410.1-202ENST00000431981 472 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 Z98752.2-201ENST00000432727 312 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 OR3B1P-201ENST00000437536 893 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 MDC1-AS1-201ENST00000442150 738 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RPL23P4-201ENST00000442836 416 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC147651.1-201ENST00000453149 572 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC012501.1-201ENST00000454312 555 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 OR2A1-AS1-203ENST00000468575 568 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC233724.1-201ENST00000503894 233 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 ENPP7P10-201ENST00000504828 933 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC112173.1-201ENST00000505876 327 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC008496.1-201ENST00000509131 295 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC025176.1-201ENST00000510261 365 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 ST13P6-201ENST00000522430 1102 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 SAP30L-AS1-204ENST00000524264 1039 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC069287.2-201ENST00000526963 574 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC104031.1-201ENST00000527726 372 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC018653.2-201ENST00000540190 238 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 LINC02384-207ENST00000542875 551 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC100836.1-201ENST00000557426 877 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC060809.1-201ENST00000559211 564 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC087565.1-201ENST00000565061 391 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 LINC02124-201ENST00000570087 484 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 ZNF793-AS1-205ENST00000589025 560 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.159-201ENST00000612585 265 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC242842.1-201ENST00000617712 447 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 CCDC163-207ENST00000629482 953 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 AL121594.6-201ENST00000633440 261 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 CLEC19A-205ENST00000636231 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ANKRD39Q53RE8 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 ADGRE1-203ENST00000381404 3056 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
ANKRD39Q53RE8 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms