Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 LINC02168-201ENST00000565327 352 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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