Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AC024579.1-201ENST00000503685 371 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 ARPP19-205ENST00000563566 568 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AC034238.1-215ENST00000609792 219 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AL139407.1-201ENST00000613826 1175 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
CA9Q16790 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AC021180.1-201ENST00000508581 558 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AC022832.1-201ENST00000530718 645 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 PCGEM1-201ENST00000454040 1590 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
CA9Q16790 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
CA9Q16790 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
CA9Q16790 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms