Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AL136116.2-201ENST00000404020 785 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 MGAT2P2-201ENST00000427194 797 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 ECM1P2-201ENST00000503354 1577 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AP002530.1-201ENST00000405705 684 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 SCAND3P1-201ENST00000439854 1060 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 GCSHP4-201ENST00000538792 439 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 EIF1P5-201ENST00000585002 234 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
CDKN3Q16667 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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