Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC108751.3-201ENST00000461814 1020 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC6.17□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 NPM1P18-201ENST00000434232 732 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 CYBB-201ENST00000378588 4324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms