Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 OR6C64P-201ENST00000419708 825 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC096759.1-201ENST00000510744 473 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
ITGB3BPQ13352 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms