Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC084824.2-201ENST00000548906 345 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AP005131.7-201ENST00000610087 611 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 ZNF83-202ENST00000536937 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC020779.1-201ENST00000478757 796 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 C11orf74-210ENST00000534635 801 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AL135786.2-201ENST00000608422 615 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC019193.2-201ENST00000610012 634 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 NUDT6-202ENST00000339154 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 TXNP5-201ENST00000441043 315 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SRSF5Q13243 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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