Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 CLCN3-211ENST00000613795 5874 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 FILIP1-203ENST00000393004 7807 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC005252.1-201ENST00000604518 1063 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 HMMR-204ENST00000432118 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 NAIP-210ENST00000523981 4543 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
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