Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
TTPAP49638 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AL031584.1-201ENST00000447169 754 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 MIPEPP2-201ENST00000422560 1819 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TTPAP49638 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 SH3BGR-203ENST00000380634 816 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC055758.1-201ENST00000494509 569 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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TTPAP49638 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TTPAP49638 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TTPAP49638 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TTPAP49638 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TTPAP49638 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TTPAP49638 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TTPAP49638 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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