Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-2B6SEH9 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-2B6SEH9 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-2B6SEH9 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-2B6SEH9 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-2B6SEH9 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-2B6SEH9 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-2B6SEH9 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-2B6SEH9 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-2B6SEH9 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-2B6SEH9 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-2B6SEH9 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
ERVV-2B6SEH9 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
ERVV-2B6SEH9 AC068446.1-201ENST00000556425 1549 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AL033397.2-201ENST00000508884 547 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AC099518.4-204ENST00000567047 380 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 MCM10-202ENST00000378714 4547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 AC012123.2-201ENST00000485809 248 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ERVV-2B6SEH9 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms