Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 BCAR4-204ENST00000573319 1273 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 SNURF-202ENST00000577949 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 MIR3157-201ENST00000578688 85 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC011483.2-201ENST00000594512 536 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AL589765.6-201ENST00000601909 549 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 STARD13-AS-224ENST00000608496 787 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 ZC3H14-215ENST00000555900 1762 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 FNDC3B-205ENST00000423424 408 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 MTND4LP13-201ENST00000425022 298 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AL139148.1-201ENST00000427122 680 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 C8orf44-205ENST00000521889 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC247036.1-201ENST00000605005 389 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 MIR6807-201ENST00000621968 92 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 ASB8-218ENST00000629941 278 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 NDFIP2-203ENST00000487865 1384 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 OR52N3P-201ENST00000413417 934 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
LINC00587B1AMM8 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms