Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HDAC6Q9UBN7 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HDAC6Q9UBN7 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HDAC6Q9UBN7 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HDAC6Q9UBN7 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HDAC6Q9UBN7 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HDAC6Q9UBN7 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HDAC6Q9UBN7 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HDAC6Q9UBN7 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HDAC6Q9UBN7 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HDAC6Q9UBN7 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HDAC6Q9UBN7 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HDAC6Q9UBN7 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HDAC6Q9UBN7 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HDAC6Q9UBN7 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HDAC6Q9UBN7 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HDAC6Q9UBN7 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HDAC6Q9UBN7 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HDAC6Q9UBN7 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 SCP2-205ENST00000408941 1298 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 LINC02476-202ENST00000431071 559 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
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HDAC6Q9UBN7 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 AC025263.2-201ENST00000550437 548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 ETFRF1-211ENST00000557540 1259 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 RPS15A-203ENST00000563390 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 AC105271.1-201ENST00000442876 497 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 AC093909.2-201ENST00000505178 437 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
HDAC6Q9UBN7 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
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