Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC026254.2-201ENST00000475295 371 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 RNASE11-208ENST00000555841 886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 RPSAP75-201ENST00000605848 301 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 GCNT2-203ENST00000379597 4525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC013488.1-201ENST00000526618 1838 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AP002833.3-201ENST00000625075 2265 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 KRT39-201ENST00000355612 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 CSMD2-210ENST00000619121 13430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 RN7SKP237-201ENST00000364663 301 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 GDF9-202ENST00000378673 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 SNORA11.5-201ENST00000408163 128 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC079760.2-203ENST00000418395 489 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AL731544.1-201ENST00000436500 370 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AL355390.2-201ENST00000446691 880 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 LPAL2-203ENST00000454031 2498 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC012464.1-201ENST00000550687 540 ntTSL 4 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AL133342.1-201ENST00000618168 366 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
NEDD1Q8NHV4 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms