Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 RPL23P2-201ENST00000320371 421 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1331P-201ENST00000363658 106 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 MIR421-201ENST00000365696 85 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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ZNF548Q8NEK5 AC055855.3-201ENST00000564269 578 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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ZNF548Q8NEK5 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 LAMTOR5-AS1-233ENST00000625451 470 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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ZNF548Q8NEK5 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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ZNF548Q8NEK5 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC5.36□□□□□ -1.55
ZNF548Q8NEK5 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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