Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC134980.1-208ENST00000640228 535 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 RNF10P1-201ENST00000418589 369 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 LINC01307-202ENST00000444327 771 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 CA1-224ENST00000542576 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CCDC142Q17RM4 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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