Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL353726.1-201ENST00000614041 1000 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 TCL6-203ENST00000459662 3307 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 SLC14A1-221ENST00000619403 3823 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
CCDC85BQ15834 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 CYP4Z2P-202ENST00000505841 1436 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 TTC3-201ENST00000354749 9084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC083806.2-201ENST00000617795 2685 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AMPD3-209ENST00000529507 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC084816.1-202ENST00000536744 647 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 ULK4P2-202ENST00000564187 492 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC073046.2-201ENST00000604756 527 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 SNORA74.4-201ENST00000607595 199 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 LINC00635-219ENST00000608506 482 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 CASC22-202ENST00000628396 802 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 CNTN4-AS1-201ENST00000442749 1640 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 SCAPER-203ENST00000538941 4853 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CCDC85BQ15834 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms