Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 LINC00535-203ENST00000520096 790 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC093765.1-201ENST00000603758 881 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 DMD-205ENST00000359836 7339 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 ALPK2-201ENST00000361673 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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CHD4Q14839 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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CHD4Q14839 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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CHD4Q14839 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
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CHD4Q14839 AC011462.3-201ENST00000598988 540 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
CHD4Q14839 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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