Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC008662.1-201ENST00000521805 674 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC027667.1-201ENST00000545814 304 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC010327.4-201ENST00000585911 857 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC004917.1-204ENST00000592441 701 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 ZNF675-208ENST00000601010 669 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 OR52I2-203ENST00000641896 6591 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 MIPOL1-201ENST00000327441 7185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 CASP10-205ENST00000360132 5814 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 ZNF780A-203ENST00000450241 7500 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AL139384.2-201ENST00000613809 3590 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 GCNT1P4-201ENST00000404096 329 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AL589994.1-201ENST00000404962 340 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC128689.1-201ENST00000466206 562 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC096746.1-201ENST00000501965 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SSPNQ14714 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.2 ms