Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC016885.1-201ENST00000517796 532 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 EED-203ENST00000351625 1696 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CUL4AQ13619 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AL133268.1-201ENST00000405676 1401 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 FABP4-201ENST00000256104 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 LINC01350-201ENST00000436955 642 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC034244.2-201ENST00000514668 858 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC026462.4-201ENST00000565229 951 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC005757.1-201ENST00000591432 472 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 PRUNE2-201ENST00000223609 2697 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
CUL4AQ13619 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms