Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 PHACTR4-201ENST00000373836 3107 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 NME8-203ENST00000440017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
CUL3Q13618 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC233289.1-201ENST00000403700 508 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 CMAHP-205ENST00000471416 1118 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC079298.2-201ENST00000623885 459 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 MARK2P12-201ENST00000420129 585 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AL121957.1-202ENST00000437040 329 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CUL3Q13618 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
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