Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 FSHB-202ENST00000417547 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 BCL2A1-201ENST00000267953 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 TAAR1-201ENST00000275216 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 LINC01442-201ENST00000414201 704 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC109462.1-201ENST00000491087 368 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AP001002.1-201ENST00000625148 1513 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AL513321.1-201ENST00000441175 761 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CHAF1AQ13111 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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