Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC233702.9-201ENST00000581528 203 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC005358.1-201ENST00000445508 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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FOXD4Q12950 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
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FOXD4Q12950 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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FOXD4Q12950 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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FOXD4Q12950 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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FOXD4Q12950 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 SPATA42-201ENST00000369989 535 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 TPT1-204ENST00000379060 764 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
FOXD4Q12950 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
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