Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PTPN13Q12923 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AL355592.1-201ENST00000450292 386 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 CNTN3-201ENST00000263665 4948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC012506.4-201ENST00000421563 541 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
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PTPN13Q12923 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 RPL7P40-201ENST00000481703 745 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 OR11H3P-201ENST00000554547 982 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PTPN13Q12923 AC067852.5-201ENST00000589299 310 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
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